PDB BioPython- 좌표 추출

Question

저는 Python을 처음 접했습니다. PDB 파일이 주어진 상태에서 원자의 벡터를 계산하여 입력으로 좌표를 전달하는 BioPython의 함수가 있습니까?

[OR]

는 PDB 파일과 별도로 좌표를 추출하는 바이오 파이썬 기능이 있는가?

Answer 1

원자를위한 그런 방법이 있습니다. surplringsingly get_vector()이라고합니다.

from Bio.PDB import PDBParser 


p = PDBParser() 
s = p.get_structure("4K5Y", "4K5Y.pdb")      

for chains in s: 
    for chain in chains: 
     for residue in chain:        
      for atom in residue: 
       print(atom.get_vector()) 

는 그 후, 당신은 here

을 문서화 각 Vector 객체에 사용할 수있는 몇 가지 방법이