Blast에 의한 어떤 결과도 줄 수 없지만 FASTA에 의한 결과를 얻을 수있는 서열을 찾는 방법은 무엇입니까?

Question

Blast를 사용하여 결과를 얻을 수없는 dna 또는 단백질 시퀀스 (쿼리)를 찾아야합니다. 동시에 FASTA 도구에 넣을 때 결과를 제공해야합니다.

무엇을 찾을 수 있습니까?

Answer 1

FASTA 도구는 EMBL-EBI http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/fasta/에 의해 만들어지며 UniProt 데이터베이스를 사용합니다. NCBI의 BLAST 도구는 here으로 나열된 여러 데이터베이스를 사용합니다. UniProt은 Swiss-Prot, TrEMBL 및 PIR-PSD 데이터베이스를 결합하여 만든 '단백질 데이터의 중앙 저장소'(Wikipedia 항목 참조)라는 '범용 단백질 자원'으로 알려져 있습니다. BLAST 사이트에서 TrEMBL 데이터베이스가 리포지토리에 포함되어 있지 않은 것처럼 보입니다. 그래서 다른 데이터베이스가 아닌 TrEMBL에로드 된 시퀀스를 찾습니다.