임의의 RNA 전 사체를 생성하는 프로그램을 작성하려고합니다. 모든 4 개의 RNA 염기가 동등한 확률을 가지며, 각 서열은 시작 코돈으로 시작하고 종료 코돈이 도입 될 때만 끝납니다. import random
def random_rna():
rna = 'AUG'
stop_codon = ['UAG','UAA','UGA']
wh
문자열이 주어졌으며 하나 이상의 잘못된 문자가 있으면 False를 반환하고, 그렇지 않으면 True를 반환해야합니다. 주의해야 할 것은 내장 함수와 str 연산 (예 : in, +, indexing, len)과 재귀 만 가능하다는 것입니다. 내가 지금까지 가지고하는 것은 작동하지 않습니다 : def is_valid_sequence(dna):
""" (st
내 문제는 매우 간단하지만 그것을 해결하는 방법을 알아낼 수 없습니다. 약 1 백만 개의 시퀀스 목록이 있으며 각 시퀀스는 시퀀싱 어댑터에 정렬해야합니다. Biopython의 pairwise2 도구를 사용하여 파이썬에서 정렬 작업을 할 생각입니다. 나는 모든 정렬 점수를 수집하고, 수학을하고, 수학에 기반한 순서를 선택해야하기 때문에이 도구를 사용하고 싶습
일련의 핵산을 해당 아미노산으로 변환하는 크롬 확장 기능을 만들고 있는데 사용자 입력의 유효성을 검사하는 데 문제가 있습니다. . 궁극적으로 사용자가 대문자 또는 소문자 (숫자, 특수 문자, 공백 등) 만 입력했는지 확인하고 싶습니다. 용납 될 수없는 문자가 발견되면 사용자에게 잘못된 입력을 경고합니다. 그렇지 않으면 프로그램이 정상적으로 진행되며 오류/경
저는 파이썬 3을 배우려고 애쓰는 데 어려움을 겪고 있습니다. 지금 당장이 운동에 어려움을 겪고 있습니다. DNA 서열이다 1) 캐릭터 : I는 두 인자를 함수를 작성한다. 2) 인수와 동일한 길이 (또한, DNA 서열) 함수가 플로트 (두 DNA 서열 내의 동일한 염기의 비율을 리턴해야하는 문자열). seq_similarity("ATGC","AGTT")
데이터 시퀀스에 DNA 시퀀스가 포함되어 있습니다.이를 데이터 표현식으로 변환하고 싶습니다. 이 문서에서와 마찬가지로 : 이 과정은 무엇인가 (변환), 나는 그것에 대해 검색 할? 어떻게 파이썬으로 적용 할 수 있습니까? 큰 배열로 데이터 집합 입력으로 할 수 있습니까?
Java로 처리하는 방법을 간단하게 해결하는 많은 답변이 있음을 알고 있지만에서 구현할 수있는 구현과 개념적으로 비슷한 솔루션을 찾고 있습니다. 그것이 나에게 훨씬 친숙하기 때문에. Java 함수 cgRatio은 DNA 문자열을 가져 와서 모든 문자열을 검색하여 문자열의 "C"및 "G"문자 값의 수를 계산하고 문자열 길이에 비례하여 비율을 반환합니다. 나는
나는 Canu assembler 프로그램을 실행하기 위해 PHP exec() 함수를 사용하고 있으며 동일한 스크립트 내에서 프로세스 ID를 가져 오려고합니다. exec() PID가 반환되지 않아 프로세스가 성공적으로 실행 중이던 문제가 있습니다. 프로세스는 다음과 같이 시작됩니다 : 또한 $pid = exec($command, $output);
var_d
이것은 제목에 명시된대로 내 목표를 달성해야하는 코드입니다. 지금 당장 가지고있는 문제는 두 번째 코드 줄입니다. 프로그램을 추가하자마자 오류없이 프로그램이 작동을 멈췄습니다. 도움에 미리 감사드립니다. seqDNA = input()
seqDNA = seqDNA.upper()
comp = ''
for c in seqDNA:
if c == 'a
어떻게 페어 엔드 fastq 파일을 통해 루프 할 수 있습니까? 하나의 끝이 읽는 동안 나는 한 쌍 엔드 파일을 편집 할 경우, 그러나 다음 library(ShortRead)
strm <- FastqStreamer("./my.fastq.gz")
repeat {
fq <- yield(strm)
if (length(fq) == 0)