모서리로 연결된 점의 애니메이션 그래프

나는이 question과 비슷한 질문을하지만, 매우 많은 수의 점을 그리는 대신 점과 모서리가 더 적지 만 (최소 10 개 요인) 애니메이션 효과를 원합니다. 그들. 그것은 진화하고 변형 된 사각형 lattic처럼 보이는 2D 맵,와 코호 넨 네트워크의 시각화가보다 구체적으로, 위키 백과에서이 이미지를 참조하십시오모서리로 연결된 점의 애니메이션 그래프

는 this 대답의 코드를 촬영 약간 수정 최소한 예는 다음과 같다 :

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 

def getXY(points, edges): 
    """Return x and y arrays to pass to the plot function""" 
    return [points.T[i][edges.T] for i in np.arange(points.shape[1])] 

points = numpy.array([[1,2],[4,5],[2,7],[3,9],[9,2]]) 
edges = numpy.array([[0,1],[3,4],[3,2],[2,4]]) 

lines = plt.plot(*getXY(points, edges), linestyle='-', color='y', 
     markerfacecolor='red', marker='o') 
plt.show()

을 그리고, 갱신이 점 '좌표 변화하는 발생 :

points += 1 # simplified version of a real update

,174,515을

변경되지 않습니다 플롯 창에서 다른 데이터가 있기 때문에 나는 모든 것을 replot하는 "바보"방법을 피하기 위해 싶습니다이 정말 느린 제 1 단계로

# repeat after each update all the calculation 
plt.cla() 
x, y = [points.T[i][edges.T] for i in np.arange(points.shape[1])] 
lines = plt.plot(x, y, linestyle='-', color='y', 
     markerfacecolor='red', marker='o') 
plt.show()

, 내가 저장 변수 lines의 초기 플롯에서 작성된 Line2D 데이터 지금 직면 한 문제는 라인 데이터를 업데이트하려는 경우, 내가 생각해 낼 수있는 유일한 해결책은 모든 라인을 반복해야한다는 것입니다.이 라인은 나에게 매우 우아하지 않습니다.

x, y = getXY(points, edges) 
if len(lines) > 1: 
    for i, d in enumerate(zip(x.T, y.T)): 
     lines[i].set_data(d) 
else: # has to be treated seperately, since the format of x and y is different 
    lines[0].set_data(x, y) 
plt.show()

나는

은 (지정된 연결로 포인트를 플로팅) 초기 문제의 해결 방법에 대한 내을위한 루프
아이디어보다 더 나은 솔루션을 함께 가자 ... 방법을 제안 찾고 있어요 더 우아한 방법

출처

2012-02-23 Markus

가능한 한 가지 방법은 다음과 같습니다. 줄의 좌표에 NaN 또는 없음이있는 경우 기본적으로 선 세그먼트의 끝으로 처리된다는 사실을 사용할 수 있습니다. 다음 non-none 점은 새로운 세그먼트의 시작으로 간주됩니다. 예를 들어, 방금 할 수있는 0.2에서 0.1 및 y 축으로 X 축을 이동 좌표를 업데이트하기 위해 지금

import numpy as np, matplotlib.pyplot as plt 
x,y = np.array([1, 4,2, 3, 9]), np.array([2, 5, 7, 9, 2]) 

edges = np.array([[0, 1], 
    [3, 4], 
    [3, 2], 
    [2, 4], 
    [2, 1]]) 

ys=np.vstack((y[edges[:,0]],y[edges[:,1]],y[edges[:,0]]+np.nan)).T.flatten() 

xs=np.vstack((x[edges[:,0]],x[edges[:,1]],x[edges[:,0]]+np.nan)).T.flatten() 

lines2d = plt.plot(xs,ys,marker='o')

oldx,oldy=lines2d[0].get_data() 
lines2d[0].set_data(oldx+.1,oldy+.2) 
plt.draw()

PS 내가 그 완전히 확실하지 않다 내 xs, ys 배열에 Nans를 삽입하는 방법이 가장 빠르지 만 실제로는 별 문제가되지 않습니다.

출처

2012-03-16 02:59:30

모서리로 연결된 점의 애니메이션 그래프

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