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의 여러 요인에 의해 패 시팅은 내가 R의 ggplot의 geom_boxplot와 facetted 방식으로 그릴려고하는 data.frame이 두 가지 요소가이 예에서색상 및 ggplot
set.seed(1)
vals <- rnorm(12)
min.vals <- vals-0.5
low.vals <- vals-0.25
max.vals <- vals+0.5
high.vals <- vals+0.25
df <- data.frame(sample=c("c0.A_1","c0.A_2","c1.A_1","c1.A_2","c2.A_1","c2.A_2","c0.B_1","c0.B_2","c1.B_1","c1.B_2","c2.B_1","c2.B_2"),
replicate=rep(c(1,2),6),val=vals,min.val=min.vals,low.val=low.vals,max.val=max.vals,high.val=high.vals,
group=c(rep("A",6),rep("B",6)),cycle=rep(c("c0","c0","c1","c1","c2","c2"),2),
stringsAsFactors = F)
하는 나는 facet 싶습니다
facet.factors <- c("group","cycle")
for(f in 1:length(facet.factors)) df[,facet.factors[f]] <- factor(df[,facet.factors[f]],levels=unique(df[,facet.factors[f]]))
levels.vec <- sapply(facet.factors,function(f) length(levels(df[,f])))
그러나 다른 경우에 나는 하나 또는 두 개 이상의 요소가있을 수 있습니다.
facet_wrap에 전달할 수있는 방법은 패싯 수와 열 수의 벡터입니까? 분명히이 오류가 발생합니다
library(RColorBrewer,quietly=T)
library(scales,quietly=T)
level.colors <- brewer.pal(sum(levels.vec),"Set2")
require(ggplot2)
ggplot(df,aes_string(x="replicate",ymin="min.val",lower="low.val",middle="val",upper="high.val",ymax="max.val",col=facet.factors,fill=facet.factors))+
geom_boxplot(position=position_dodge(width=0),alpha=0.5,stat="identity")+
facet_wrap(~facet.factors,ncol=max(levels.vec))+
labs(x="Replicate",y="Val")+
scale_x_continuous(breaks=unique(df$replicate))+
scale_color_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+scale_fill_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+
theme_bw()+theme(legend.position="none",panel.border=element_blank(),strip.background=element_blank(),axis.title=element_text(size=8))
:
Error in combine_vars(data, params$plot_env, vars, drop = params$drop) :
At least one layer must contain all variables used for facetting
을 분명이 작품 : 여기에
는 추가로 내가 각 요인 수준에 대한 내 자신의 색깔을 만들어 어디 시도 무엇ggplot(df,aes_string(x="replicate",ymin="min.val",lower="low.val",middle="val",upper="high.val",ymax="max.val",col=facet.factors,fill=facet.factors))+
geom_boxplot(position=position_dodge(width=0),alpha=0.5,stat="identity")+
facet_wrap(group~cycle,ncol=max(levels.vec))+
labs(x="Replicate",y="Val")+
scale_x_continuous(breaks=unique(df$replicate))+
scale_color_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+scale_fill_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+
theme_bw()+theme(legend.position="none",panel.border=element_blank(),strip.background=element_blank(),axis.title=element_text(size=8))
그러나 나는 통과하고 전설을 추가하지 않는 색상을 무시하고 col 및 fill을 aesthetics에 vector을 전달할 수 없기 때문에 상상할 수 있으며 분명히 패싯을 하드 코딩해야합니다.
이것은 facetting 문제에 대한 중 하나가 작동하지 않습니다
ggplot(df,aes_string(x="replicate",ymin="min.val",lower="low.val",middle="val",upper="high.val",ymax="max.val",col=facet.factors,fill=facet.factors))+
geom_boxplot(position=position_dodge(width=0),alpha=0.5,stat="identity")+
facet_wrap(facet.factors[1]~facet.factors[2],ncol=max(levels.vec))+
labs(x="Replicate",y="Val")+
scale_x_continuous(breaks=unique(df$replicate))+
scale_color_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+scale_fill_manual(values=level.colors,labels=unname(unlist(sapply(facet.factors,function(f) levels(df[,f])))),name="factor level")+
theme_bw()+theme(legend.position="none",panel.border=element_blank(),strip.background=element_blank(),axis.title=element_text(size=8))
facet_wrap의
df$col.fill <- Reduce(paste, df[facet.factors])
facets 문자 벡터 또는 하나 모두 허용합니다
