php 또는 javascript에서의 계층 적 클러스터링

Question

저는 현재 약물을 분석하고 결과를 유사성 패턴에 따라 그룹화해야하는 생물 정보학 프로젝트를 진행 중입니다.

이를 위해 유클리드 거리와 마할 라 노비스 거리와 같은 알고리즘을 사용합니다. 현재 도서관 Clusterfck을 사용하고 있지만 매우 제한적이며 정보가 기본적으로 완전히 생성됩니다.

JavaScript 또는 PHP에 이러한 계산을 구현 한 다른 라이브러리가 있는지 궁금합니다.

Answer 1

실제 데이터로 작업 할 때 Javascript 나 PHP를 사용하지 않는 것이 좋습니다. 둘 다 해석되고 느리며 웹 컨텐트를 렌더링하고 표시하는 데 더 적합합니다. 같은 이유로 Javascript에서 clusterfck가 아닌 다른 라이브러리를 너무 많이 찾을 수 없습니다. 다른 언어로 분석하는 것이 더 좋으며이를 사용하여 분석하십시오.

, 나는 다른 언어로 몇 가지 라이브러리를 공유 할 수 있습니다 :

• clustering in scipy
• scipy-cluster는 확장이 scipy에 그와 유사한 물건을
• hac, 자바 구현
• fastcluster에 대한 작업을 수행 R 및 Python