2012-12-19 3 views
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필자는 페어 와이즈 levenshtein의 거리로 구성된 거리 매트릭스를 가지고 있습니다. 나는 scikits-learn을 사용하고있었습니다. 그러나 계층 적 클러스터링 알고리즘은 클러스터링을위한 입력으로 거리 매트릭스를 사용하지 않습니다. 그래서 나는 이것을 할 수있는 새로운 꾸러미를 찾아야한다.파이썬에서 거리 매트릭스를 취하는 좋은 계층 적 클러스터링 패키지가 있습니까?

계층 적 클러스터링에 사용한 패키지가 빠르고 테스트가 잘되어 있습니까?

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내가 찾은 다른 대안은 [fastcluster package] (http://math.stanford.edu/~muellner/fastcluster.html)에서 호스팅됩니다. – darshan

답변

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(sklearn의 연결성 제한이 필요하지 않은 Ward의 백업 구현으로 사용)을 scipy.cluster.hierarchy.ward 기능은 관찰과 미리 계산 된 거리 (자세한 내용은 online documentation 참조) 모두를 수용 할 수 있습니다. 그것은 아직 sklearn의 API에 노출되지 않았습니다.

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