url에 gene id 목록을 전달하는 방법은 무엇입니까?

Question

url에 gene id 목록을 전달하려고합니다. gl은 gene id 목록을 저장합니다. 목록의 요소를 반복하고 정의 된 함수를 수행하려면 "?term="이 필요합니다. 나는 긍정적 인 아니에요

import re 
import urllib2 

def sr(): 
    gl = [6323,6513] 

    # need to pass the list gl here: 
    s = urllib2.urlopen('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=','r') 

    h = s.read() 
    s.close() 
    acc = re.search('gi=(.+?)&amp',h) 
    if acc: 
      ac = acc.group(1) 
      f = open("E:/t.txt", "w") 
      f.write(ac); 
      f.close() 

Answer 1

난 당신이 찾고있는 것을 이해하지만, 아마도 urllib.urlencode은 당신이 찾고있는 무엇인가? urlencode은 쿼리 문자열을 생성합니다. 이 URL을 기본 URL 인 urllib.urlopen과 함께 전달할 수 있습니다.

term의 값을 쉼표로 구분해야한다고 가정합니다.

gl = [6323,6513] 
params = urllib.urlencode({"term": ','.join(map(str, gl))}) 
s urllib.urlopen('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/', params) 

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피터 수탉이 코멘트에서 언급 한 바와 같이, 당신은 Entrez의, NCBI의 공식 API ( guide here)를 사용하는 것이 더 낫다. Bio.Entrez은 멋진 인터페이스를 제공합니다.