R 열 순서별 테이블 목록 및 상위 100 행 선택

Question

큰 테이블 results.list에 22 개의 테이블 (6 개 변수 중 23544 개)이 포함되어 있습니다.

각 열을 특정 열 (FDR)로 찾아서 거짓 발견 비율을 선택하고 처음 100 행을 선택하고 싶습니다. 간단한 R 명령을 사용하여 수동으로이 작업을 수행 할 수 있습니다.

attach(results.list$adult.OLFvsVTA) 
sort(FDR) 
detach(results.list$adult.OLFvsVTA) 
adult.OLFvsVTA100<-adult.OLFvsVTA[1:100,] 

모든 22 개 테이블의 상위 100 개 행을 결합하고자합니다. 결합 된 벡터에서 FDR 값을 원하지 않지만 상위 100 개의 행을 하나의 열 (유전자)으로 결합하고자합니다. 적용 함수를 사용하여이 프로세스를 자동화하고 싶습니다. 일련의 시도에도 불구하고 나는 그것을 작동시키지 못합니다. r.names이라는 또 다른 벡터를 작성했습니다.이 벡터에는 내 적용 함수에 입력 할 계획 인 모든 목록의 22 개 테이블 이름이 들어 있습니다. 여러 도움말 페이지를 읽었지만 제대로 작동하지 않습니다. 어떤 도움을 주시면 감사하겠습니다.

Answer 1

do.call(rbind, lapply(results.list, function(dd) { dd[with(dd, order(FDR)),][(1:100), ]})) 

정도로 가정 results.list 우리 적용 할 데이터 프레임의리스트 (lapply리스트위한) FDR하여 그들을 정렬하고 제 100 행 (기능 (DD)을 {잡고 함수이다 .. .} < - 열별로 정렬하기위한 다른 stackoverflow 게시물에서 도난 당함)을 각 데이터 프레임에 적용합니다. 이 결과는 데이터 프레임 목록이됩니다. 함수을 사용하는 멋진 함수 인 do.call을 호출하고 목록에서 목록에서 우리의 함수에 대한 인수로 분해 될 목록을 호출 할 수 있습니다. 이 경우 함수는 rbind가 X 개의 행 테이블 100 개를 취하여 하나의 큰 테이블을 만듭니다. 추가 설명이 필요하면 알려주세요.