파이썬에서 두리스트의 교차 부분을 얻는다.

Question

나는 분석 할 유전자 목록이 두 가지있다. 본질적으로 나는이 목록의 요소를 Venn 다이어그램과 같은 방식으로 정렬하려고합니다. 즉, 목록 1에서만 발생하는 요소는 하나의 목록에 배치되고 목록 2의 요소는 다른 요소에 포함되며 두 요소 모두에서 발생하는 요소는 제삼. 지금까지

내 코드 :

from Identify_Gene import Retrieve_Data #custom class 
import argparse 
import os 

#enable use from command line 
parser = argparse.ArgumentParser(description='''\n\nFind the intersection between two lists of genes\n ''') 
parser.add_argument('filename1',help='first list of genes to compare') 
parser.add_argument('filename2',help='second list of genes to compare') 
parser.add_argument('--output_path',help='provide an output filename') 
args = parser.parse_args() 

os.chdir(args.output_path) 

a = Retrieve_Data() # custom class, simply produces a python list 
list1 = a.parse_gene_list(args.filename1) 
list2 = a.parse_gene_list(args.filename2) 

intersection = [] 
list1_only = [] 
list2_only = [] 
if len(list1)>len(list2): 
    for i in range(0,len(list1)): 
     if list1[i] in list2: 
      intersection.append(list1[i]) 
     else: 
      list1_only.append(list1[i]) 
    for i in range(0,len(list2)): 
     if list2[i] not in list1: 
      list2_only.append(list2[i]) 
else: 
    for i in range(0,len(list2)): 
     if list2[i] in list1: 
      intersection.append(list2[i]) 
     else: 
      list2_only.append(list2[i]) 
    for i in range(0,len(list1)): 
     if list1[i] not in list2: 
      list1_only.append(list2[i]) 




filenames = {} 
filenames['filename1'] = 'list1_only.txt' 
filenames['filename2'] = 'list2_only.txt' 
filenames['intersection'] = 'intersection.txt'     

with open(filenames['filename1'],'w') as f: 
    for i in range(0,len(list1_only)): 
     f.write(list1_only[i]+'\n') 

with open(filenames['filename2'],'w') as f: 
    for i in range(0,len(list2_only)): 
     f.write(list2_only[i]+'\n') 

with open(filenames['intersection'],'w') as f: 
    for i in range(0,len(intersection)): 
     f.write(intersection[i]+'\n') 

이 프로그램은 현재와 같은 list1_only 나에게 두 개의 동일한 목록을 제공하고 list2_only가 상호 배타적이 있어야 할 곳에. 생성 된 교차 파일은 다르지만 다른 두 목록이 예상대로 작동하지 않기 때문에 신뢰할 수 있다고 생각하지는 않습니다.

나는이 작업이 쉽게 교육 목적을 위해, 그러나 파이썬 '설정'모듈을 통해 수행 할 수 있음 (이 질문을 게시 이후) 통보 한 나는 여전히 매우

Answer 1

이 있습니다이 프로그램을 수정하고 싶습니다 목록 작성시 버그. 섹션에서

가 :

for i in range(0,len(list1)): 
    if list1[i] not in list2: 
     list1_only.append(list2[i]) 

마지막 줄이 있어야한다 :

 list1_only.append(list1[i]) 

Answer 2

당신은이 편리한 웹 사이트를 체크 아웃 할 수 있습니다 :

http://jura.wi.mit.edu/bioc/tools/compare.php