rpy2 플롯 문제

Question

Windows XP에서 rpy2-2.0.8, R-2.11.1, Python-2.6.2를 사용합니다.

이 스크립트를 실행하면 출력 이미지가 텍스트 메시지로 채워집니다. 이 메시지는 clusplot의 함수 정의라고 가정합니다.

[test.py]

#!/usr/bin/env python 
# -*- mode: python -*- -*- coding: utf-8 -*- 

import rpy2.robjects as ro 
r = ro.r 

# read from csv file 
dataf = r('read.csv("test.csv", header=T, row.names="name")') 

# k-means 
r.library('cluster') 
k = 2 
cluster = r.kmeans(r.cmdscale(r.dist(dataf)), k) 

# plot 
r.jpeg('output.jpg') 
r.clusplot(r.pam(dataf, k)) 
r('dev.off()') 

[test.csv]

name,a,b,c,d,e,f,g,e,h,I,j,k 
x1,1421,99.4,19.5,241.4,103.7,18.8,13.4,4.8,76.3,535.6,28.6,10.3 
x2,1495,97.8,22.5,263.3,160.3,9.1,13.7,4.3,93.8,568,33.3,10.4 
x3,2649,95.8,14.6,198.6,94.6,15.9,11.6,11.7,85,521.5,52.7,8.71 
x4,3251,100.2,27.5,240.9,121,28,13.3,18.9,99.1,336.1,5.1,3.03 
x5,2705,100.3,15.3,157.1,95.3,23.4,7.5,17,87.9,366.8,12.1,3.59 
x6,3157,100.3,12.4,164,97.1,10.2,8.8,17.4,98.4,418.5,24.2,4.45 
x7,2045,104.4,25.3,246.3,131,16.6,14,19.1,96.9,584.2,7.8,6.73 
x8,2228,99.1,21.7,246.9,112.2,23.3,15.1,5.3,88.4,415.5,54.2,4.03 
x9,2037,100.1,30,296.6,150.7,31.5,15.4,17.8,93.1,346.8,6.1,3.47 
x10,2336,99.7,17.6,210.8,116.5,21.5,12.6,10.1,69.9,411,63.9,16.5 
x11,1264,101.8,29.3,256.1,126.2,14.3,14.8,5.4,94,540.1,28.5,7.46 
x12,1566,98.8,23.7,285.3,128.6,15.1,15.5,8.5,91.5,549.3,59.2,10.5 
x13,2210,98.8,28.3,234.4,143.2,17.3,12.7,11.2,95.6,492.1,53.5,8.6 

하지만 R 콘솔 (안 RPY2), 없음 텍스트 overwapping 문제를 사용합니다.

나를 도와주는 사람이 있습니까?

Answer 1

이 문제는 혼자서 해결했습니다.

R plot 명령이 주어지지 않으면 자동으로 플롯 제목을 완성합니다. 콘솔 및 rpy2를 통한 R 명령은이 보완에 대해 다른 동작을합니다. (나는 rpy2에 대한 버그라고 생각한다.)

이렇게 제목을 "main"인수로 명시 적으로 설정한다.

# plot 
r.jpeg('output.jpg') 
r.clusplot(r.pam(dataf, k), main="result") 
r('dev.off()')