최근 몇 가지 세균 시퀀싱 데이터를 분석하기 위해 breseq을 사용하려고했습니다. 그러나 breseqbowtie2을 사용하면 원시 데이터를 참조 게놈에 정렬 할 때 치명적인 오류가 발생합니다. 이 +++ NOW PROCESSING Read alignment to reference genome [system] bowtie2-build -q test_bres
나는 GPS 점을 색인과 함께 저장합니다.이 점에서이 점을 참조하면 GPS [0], GPS [1]와 같이 보입니다. GPS는 GPS 위치 및 [n]은 GPS 위치 배열의 색인입니다. - 항상 첫번째 인덱스 GPS [에서 도로 GPS [0] = 개시 : 여기 난 (어레이는 11 개 개의 위치를 포함이 예에서) 위치를 기억 될 예정 어떻게 - 9] 점에서
나는 이것에 너무 많은 시간을 할애하여 제안을 찾고 있습니다. 너무 큰 파일 (관심있는 사람들을 위해 Illumina 시퀀싱을 실행하는 FASTQ 파일)이 있습니다. 내가해야 할 일은 두 파일 사이의 패턴을 일치시키고 그 라인과 그 아래 3 줄을 중복되지 않은 두 개의 별도 파일 (원본 파일에 있음)로 인쇄하는 것입니다. Grep은이 작업을 훌륭하게 수행하
Illumina NextSeq에서 실행 한 일부 .fastq 파일이 있습니다. 많은 서열은 poly-A 영역을 가지고있어이를 매핑하는 것을 복잡하게 만든다. 나는 10 연속 A의 모든 시퀀스를 제거하려면 다음과 같이 fastx_clipper 사용하여 그렇게하도록 노력 해왔다 : ha1c6n8$ fastx_clipper -l 32 -Q33 -n -v -a A
내 정렬 파일을 bowtie 및 samtools 형식으로 둘 다 필요하므로 나중에 내 파이프 라인에서 다른 프로그램에 제공 할 수 있습니다. sam 정렬 파일을 bowtie 정렬 파일로 변환하는 데 사용할 수있는 방법이 있습니까? 대체 방법으로 정렬을 두 번 수행하고 bowtie 프로그램을 통해 각각 다른 형식으로 출력 할 수 있습니다. 그러나 이것은 너무
왼쪽 및 오른쪽 신발이 섞여있는 테이블이 있습니다. 그 중 일부는 방수 기능이 있습니다. 알파벳순으로 정렬하려면 쿼리를 작성해야하지만 이름이 같은 경우에는 왼쪽/오른쪽의 방수 열을 사용하십시오. +-------------------------+------------+------------+
| Shoe name | Waterproof | Left/R
App-V 5.1에서 작업하고 있습니다. [Change History] 탭의 "Package Version GUID"는 무엇을 의미합니까? 이 값은 [등록 정보] 탭의 "패키지 버전 GUID"와 다릅니다. 또한 패키지를 추가 한 후에이 값을 찾을 수 없습니다. appv xml 매니페스트에 패키지를 게시합니다. 이 [변경 기록] 탭은 어떤 의미입니까?
정말 R에 새로운 것이므로 정말 감각이 없으면 미안합니다. 나는 STAND라고 불리는 여러 다른 영역에서 수집 된 데이터가있는 DF를 가지고 있습니다. 1 : 3에서 실행되는 데이터를위한 시퀀스를 생성해야하지만, 새로운 STAND 번호에 관해서는 시퀀스를 다시 시작해야합니다. STAND TREE_SPECIES DIAMETER SEQ
1 101737 Pi