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OpenMP 스레드는 작업 스케줄러 (예 : LSF)가 할당 한 특정 코어에 어떻게 맵핑됩니까?

작업 스케줄러로 프로그램을 실행하면 스케줄러는 n 프로세서 코어 (사용자가 지정)를 작업에 할당합니다. OpenMP를 사용하는 프로그램이 실행될 때 OpenMP는 일반적으로 OMP_NUM_THREADS 개의 스레드를 사용합니다.이 스레드는 각기 다른 프로세서 코어에 매핑됩니다. OpenMP는 어떤 코어가 스케줄러 (afaik)에 의해 프로그램/작업에 할당되

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bsub 바로 다음에 bjob 정보 기록

제출 된 작업이 시작된 직후에 파일에 정보를 기록하는 방법을 찾고 있습니다. 일반적으로 모든 작업 상태는 작업이 완료된 후에 로그 파일에 추가되지만 시작될 때의 정보를 알고 싶습니다. 내가 거기에 알고는 -B 플래그입니다하지만 난 파일에서 그것을 원하고, 나는 또한처럼 뭔가를 할 수 : BSUB -J jobby -o run_job.log bjobs -l -

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LSF 일괄 처리 작업에서 grep -v를 통해 표준 오류를 리디렉션

표준 출력에 전체 톤을 생성하는 라이브러리를 사용하고 있습니다. (실제로 코드에서 직접 출력을 억제 할 방법이 없으며 ROOT의 Minuit2 최소화 기가 있습니다. 출력을 억제하는 방법이없는 것으로 알려져 있습니다). LSF 시스템을 통해 배치 작업을 실행 중이며 오류 출력 파일이 너무 커서 디스크 할당량을 초과합니다. Erk. 이 위대한 작품을 here

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bash와 bash 함수를 호출 bsub lsf 내에서 bash 스크립트

나는 bash 함수를 내가 bsub 싶습니다. 그것은 스크립트를 소스로하려고 할 때 재귀 적으로 호출되지만, 스크립트를 소스 화하지 않으면 내 기능을 인식하지 못하는 것 같습니다. 동일한 스크립트 파일 내의 함수에 대해 besub을 올바르게 호출하려면 어떻게해야합니까? my_script를 ("12345"를 인쇄해야합니다) : #! /bin/sh funct

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LS에서 이맥스에서 R을 실행

ESS를 사용하여 이맥스에서 R을 실행하고 싶습니다. 내 R 세션은 대화식으로 실행되지만 LSF를 사용하여 다른 호스트에 제출됩니다. 이 일을 할 수있는 방법이 있습니까? 즉, R은 로컬에서 실행되지 않습니다. 그러나 ESS는 자원을 제한하기 때문에 작동하지 않는 로컬 사본을 실행하는 것으로 보입니다. ESS가 R을 실행하기 위해 실행해야하는 명령을 지정하

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lsf 클러스터에서 mpi 작업 제출

저는 대개 대학의 클러스터에서 데이터를 처리합니다. 이전에 수행 된 대부분의 작업은 병렬 배치 쉘 (작업을 여러 배치로 나누어 병렬 처리)에 기반합니다. 이 셸의 예는 다음과 같습니다. #! /bin/bash #BSUB -J model_0001 #BSUB -o z_output_model_0001.o #BSUB -n 8 #BSUB -e z_output

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다른 하나의 MPI 프로세스가 두 개 이상의 스레드를 가지고있을 때 LSF 용 일괄 처리 스크립트

내 프로그램은 MPI + pthreads를 사용합니다. 여기서 n-1 MPI 프로세스는 순수 MPI 코드이고 단 하나의 MPI 프로세스는 pthreads를 사용합니다. 마지막 프로세스에는 2 개의 스레드 (메인 스레드 및 pthread) 만 있습니다. 이 프로그램을 실행하려는 HPC 클러스터가 12 개의 코어를 가진 컴퓨팅 노드로 구성되어 있다고 가정합니다

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SLURM은 완료되지 않은 작업의 stdout과 stderr를 표시합니다.

저는 LSF가있는 서버를 사용했지만 지금은 SLURM을 사용하여 서버로 전환했습니다. SLURM에서 bpeek (LSF 용) 명령과 동일한 명령은 무엇입니까? 난 아무데도 문서를 찾을 수 없습니다 미완성 작업의 표준 출력과 표준 에러 출력을 표시 bpeek bpeek . SLURM에 대한 좋은 참고 자료가 있으면 알려 주시기 바랍니다. 감사!

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lsf에서 다중 스레드 mpi 프로세스를 시작하는 방법은 무엇입니까?

나는 작업 제출 LSF를 사용하려면 각 노드가 하나의 MPI 프로세스를 가지고 4 개 노드에서 실행, 병렬 의를 각 프로세스는 12 개 스레드 있다 LSF가 없으면 다음과 같이 4 노드에서 mpi로 간단히 시작합니다. mpirun -hosts host1, host2, host3, host4 -np 4 ./myprocess --numthreads = 12 그

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bjobs 출력 정렬

submit_time을 기준으로 bjobs 출력을 정렬하는 방법이 있습니까? 또는 다른 분야에 따라? JOBID USER STAT QUEUE FROM_HOST EXEC_HOST JOB_NAME SUBMIT_TIME