나는 변수 a 같은 NCBI 참조 시퀀스 가입 번호 함께 일하고 : a <- c("NM_020506.1","NM_020519.1","NM_001030297.2","NM_010281.2","NM_011419.3", "NM_053155.2")
내가 가입 번호 후 .1, .2 등을 제거하는 데 필요한 biomart 패키지에서 정보를 얻으려면. 나는 일반적으로
유전자에 대한 긴 데이터 프레임과 다양한 형태의 ID가 있습니다 (예 : OMIM, Ensembl, Genatlas). 각 유전자와 관련된 모든 SNP 목록을 얻고 싶습니다. (이것은 this question의 반대입니다.) 지금까지 가장 좋은 해결책은 biomaRt package (bioconductor)입니다. here을 수행 할 필요가있는 조회의 예가
Entrez의 아이디에서 유전자 기호를 얻을 수 biomaRt 패키지를 사용 할 수 없습니다 : Error in value[[3L]](cond): Request to BioMart web service failed. Verify if you are still connected to the internet. Alternatively the BioMart we
나는 그들의 P- 값과 변화 값을 매트릭스로 갖는 유전자의 목록을 가지고있다. Symbols Entrez_IDs logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B
7987405 RASGRP1 10125 -9.924e-01 6.937 -5.467e+00 7.496e-07 0.01147 5.41279
8095728 ERE