docker를 통해 rstudio-server에 rgdal을 설치하십시오.

Question

opencpu/rstudio 도커 이미지를 사용하고 있습니다. Windows 사용자이기 때문에 Docker는 가상 시스템을 통해 실행됩니다. rstudio-server를 실행 한 후 github에서 R 패키지를 설치하려고합니다. rgdal이 설치 될 때까지 모든 것이 잘 작동합니다.

나는 다음과 같은 오류 메시지가 :

Installing rgdal 
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore -- 
quiet \ 
CMD INSTALL '/tmp/RtmpJvVTTU/devtools2c362554e5/rgdal' \ 
--library='/usr/local/lib/opencpu/site-library' --install-tests 

* installing *source* package ‘rgdal’ ... 
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
configure: CC: gcc -std=gnu99 
configure: CXX: g++ 
configure: rgdal: 1.2-16 
checking for /usr/bin/svnversion... no 
configure: svn revision: 701 
checking for gdal-config... no 
no 
configure: error: gdal-config not found or not executable. 
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ 
* removing ‘/usr/local/lib/opencpu/site-library/rgdal’ 
Installation failed: Command failed (1) 
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore -- 
quiet \ 
CMD INSTALL \ 
'/tmp/RtmpJvVTTU/devtools2cd1cfd76/amun-software-Processingservice-6db3f06' 
\ 
--library='/usr/local/lib/opencpu/site-library' --install-tests 

나는이 문제를 어떻게 해결할 수

?

Answer 1

누락 된 라이브러리가 있습니다.

당신은

docker exec -it <your docker container name> bash 

누락 된 종속성을 설치할 수 있습니다

...

sudo apt-get update && sudo apt-get install libgdal-dev libproj-dev 

종료 쉘과 RStudio에서 할 ...으로는 다음에 도커 용기의 쉘에 로그인 한 경우 ...

install.packages("rgdal")