2010-01-21 4 views
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정보 이득 및 카이 제곱 통계를 사용하여 마이크로 어레이 데이터에 대한 유전자 순위 결정 방법 ?? 간단한 예제로 설명하십시오.정보 획득을 통해 유전자 순위를 매기는 방법은 무엇입니까?

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당신이 PubMed에에서 검색 않았다 자세한 내용은 InfoGainAttributeEval를 사용할 수 있습니까? http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed – Pierre

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이 질문에 대한 적절한 포럼인지 잘 모르겠습니다. 당신은 여기에 많은 프로그래머를 보게 될 것입니다, 그러나 이것은 매우 특이합니다. –

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프로그래밍과 관련이 없으므로 닫아야합니다. ** 프로그래밍에 대한 문제 도메인보다 문제 도메인에 관한 질문이 많습니다. – dsimcha

답변

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오픈 소스 기계 학습 소프트웨어 Weka을 사용할 수 있습니다. 데이터 세트를로드하고 "속성 선택"탭으로 이동하십시오. 다음 특성 평가자를 사용하십시오.

ChiSquaredAttributeEval : 클래스와 관련된 카이 제곱 통계의 값을 계산하여 특성의 가치를 평가합니다.

InfoGainAttributeEval : 클래스와 관련하여 정보 게인을 측정하여 특성의 가치를 평가합니다.

.. "검색 방법"에서 순위 지정자을 사용하십시오. 내가 정확히 질문을 이해하지

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속성은 개별 평가에 의해 순위가 그런 식으로하지만, 마이크로 어레이 데이터 분석을위한 매우 성공적인 패키지는 여기에서 찾을 수 있습니다 :

BioConductor

이것은 소프트웨어입니다 마이크로 어레이에서 데이터를 읽고 통계 분석을 수행하기위한 다양한 모듈을 갖춘 프로젝트입니다. 기술이 발전함에 따라 마이크로 어레이 데이터의 파일 형식이 끊임없이 변하고 마이크로 어레이 데이터를 분석하는 알고리즘이 크게 발전했기 때문에 이는 매우 유용합니다.

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