단백질 - 단백질 상호 작용 네트워크 데이터 세트에 대한 벤치 마크 데이터 세트

Question

특별히 클러스터링 알고리즘을 단백질 - 단백질 상호 작용 (PPI) 네트워크에 적용하고 싶습니다. 이를 위해서는 참조로 벤치 마크 데이터 세트가 필요하므로 결과를 검증 할 수 있습니다. 어떤 제안이라도 크게 주목할 것입니다.

Answer 1

van Brohee 및 van Helden (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17087821)의 단백질 - 단백질 상호 작용 네트워크에 대한 클러스터링 알고리즘 평가. 클러스터링 알고리즘 및/또는 골드 표준을 비교할 때 존재하는 많은 함정을 피할 수있는 벤치 마크 데이터가 유용하다고 생각합니다.