FASTA로 찾을 수 있지만 BLAST로 찾을 수없는 쿼리는 어떻게 찾을 수 있습니까?

Fasta에서는 결과 (안타)를 제공해야하지만 Blast에서는 그렇지 않은 시퀀스를 찾아야합니다. 그 반대의 경우도 마찬가지입니다.FASTA로 찾을 수 있지만 BLAST로 찾을 수없는 쿼리는 어떻게 찾을 수 있습니까?

그리고 나는 다소 잃었습니다.

이 시퀀스를 검색 할 때 무엇을 찾아야합니까?

2014-10-21 HiloKub

찾고 계신 것이 있습니까? FASTA와 BLAST는 완전히 다른 것들입니다. BLAST는 FASTA가 형식 인 동안 검색입니다. FASTA는 물건을 찾을 수 없습니다. – iayork

@ iayork 오, 영인의 FASTA는 원래 폭발 이전의 정렬 프로그램이었습니다. 우리가 여전히 사용하는 유일한 파일 형식은 http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA – dkatzel

입니다. https://www.biostars.org/p/116280/ – Pierre

BLAST 또는 FASTA로 서열을 찾으면 데이터베이스에서 히트를 찾았다 고 가정합니다.

나는 FASTA가 BLAST보다 다른 서열 사이의 정렬을 찾는 것이 더 좋을 수 있지만 BLAST는 비슷한 서열을 정렬하는 것이 더 낫다고 생각한다.

2014-10-21 18:30:23 dkatzel

서로 다른 시퀀스가 무엇을 의미합니까? – HiloKub

낮은 % 동일성을 갖는 @HiloKub 서열. – dkatzel

그래서 나는 불연속적인 megablast 옵션을 선택해야한다고 말하고 있습니다. 맞습니까? 그러나 나는 또한 질문에 글을 쓸 필요가있다. (블래스트는 내가 쓰는 무엇이든 적중을하기 때문에 나는 전혀 모른다.) – HiloKub

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