따옴표 값을 찾아 AWK

Question

를 사용하여 인쇄 내가 예를 들어

1000 개 행이 파일이 :

내가 좋아하는, 파일을 검색하고 문자열 FPKM 후 값을 추출 할

chr1  Cufflinks  transcript  34611  36081  1000  -  .  gene_id "FAM138A"; transcript_id "uc001aak.3"; FPKM "1.2028600217"; frac "1.000000"; conf_lo "0.735264"; conf_hi "1.670456"; cov "0.978610"; 

"1.2028600217" 

awk을 사용하면됩니까?

Answer 1

당신이 열이 FPKM가에서 보여 않는 상관 없어, 당신 수 :

grep -Po '(?<=FPKM)"[^"]*"' file 

Answer 2

당신은 AWK를 사용할 수 있지만이 그렇게 나오지도 한 줄에 간단한 대체이며이 더 적합 :

큰

$ cat file 
chr1 Cufflinks transcript 34611 36081 1000 - . gene_id "FAM138A"; transcript_id "uc001aak.3"; FPKM "1.2028600217"; frac "1.000000"; conf_lo "0.735264"; conf_hi "1.670456"; cov "0.978610"; 
$ sed 's/.*FPKM *"\([^"]*\)".*/\1/' file 
1.2028600217