OK 이렇게하면 테이블에 대한 데이터 프레임에 대해 알지 못할 수 있습니다. 필자는 mydata라는 데이터 프레임의 항목으로 구성된 tbb라는 테이블을 가지고 있습니다. 그런 다음 colsum을 사용하여 요약 통계를 작성하고 colsum을 데이터 프레임으로 다시 변환하려고합니다. 나는이 작업을 수행 할 때 단지 열로 두 개의 열 중 하나 인식하는 것 같다1 차원 테이블을 두 개의 열이있는 데이터 프레임으로 변환하는 방법
이 내 colsums
LSU-rRNA_Hsa LTR1 LTR10A LTR10B LTR10B1
309 90 351 404 183
LTR10C LTR10D LTR10E LTR10F LTR10G
181 675 173 72 231
LTR12 LTR12 LTR12B LTR12C
333 359 15 144
But when I then convert this to a dataframe I get
LSU-rRNA_Hsa 181
LTR1 675
LTR10A 173
LTR10B 72
LTR10B1 231
LTR10C 309
LTR10D 90
LTR10E 351
LTR10F 404
LTR10G 183
LTR12 379
LTR12_ 273
LTR12B 86
LTR12C 497
위대한의 결과입니다. 내가 ncol을 할 때까지는 LTR 등이 아닌 하나의 열만 있습니다. 왜 이것이 변환에 잘못 되었습니까? 코드는 다음과 같습니다.
mydata = read.table("/Users/Repeats.txt")
#General tidy up
mydata[4:6] <- NULL
mydata[5] <- NULL
names(mydata) <- c("chrom", "chromStart", "chromEnd","Rptname")
tbb <- table(mydata$chromStart,mydata$Rptname)
tbb[tbb == 0] <- NA
tbb[tbb > 0] <- 1
coll <- as.data.frame(colSums(tbb,na.rm = TRUE))
이는 아마도 행의 이름 일뿐입니다. 원하는대로 추출하고 저장할 수 있습니다. 'row.names (coll)'를 시도하십시오. –
아, 네, 그들은 행 이름입니다. 따라서 최종 목표는 행 이름에 대해 숫자를 플롯하는 것입니다. 데이터 프레임은 하나의 열 colSums (tbb, na.rm = TRUE)를 호출합니다. 그래서 이름을 가진 플롯을 만들려고 할 때 (colSums (tbb, na.rm = TRUE))) <- c ("mycol") + plot (mycol)에 x 축이 없습니다. –