는 pharse을 찾아

Question

그래서 내가 서버에서 이러한 파일이 다음 토큰 값을 캡처하는 방법이있다 :

COADREAD ATF7 Missense_Mutation NGXA-AZ-3984 P17544의 A436T을

COADREAD ATG10 Missense_Mutation NGXA-AB -A010 Q9H0Y0 H133N

내 목표는 파일의 5 열에서 캡처/저장 (그 번호를 나중에 인쇄해야 함) 436 인 토큰의 번호 (P17544)를 찾는 것입니다. 이 숫자는 6 열의 A436T에서 두 글자 사이에있는 것으로 가정합니다. 내가 할 수있는 방법이 있습니까? 이전에 lxml로 약간 작업했지만 어떻게해야할지 아직 확신하지 못했습니다. 여기

사전

에 감사 내가

파일 = 개방 ('text.txt', 'R')

조회가 무엇인가 = {} 파일의 라인

:

myid, token = file.rsplit(' ', 2)[1:] 

token = token[1:-1] 

Answer 1

간단한 방법 내장 str 방법 :

d = 'COADREAD ATF7 Missense_Mutation NGXA-AZ-3984 P17544 A436T' 
myid, token = d.rsplit(' ', 2)[1:] # will except if can't be unpacked so you know you've got exactly 2 elements... 
token = token[1:-1] 

두 문자 사이의 숫자를 지정하고 싶었 경우하지만 당신은 정규 표현식을 사용할 수 있습니다 ... re.match('[A-Z](\d{3})[A-Z]', token[1]) # or similar...

대한 설명 :

d.rsplit(' ', 2) - ['COADREAD ATF7 Missense_Mutation NGXA-AZ-3984', 'P17544', 'A436T'] 을 반환하는 끝에서 ' ' s의 문자열을 분할하기 시작합니다. 마지막 두 요소 만 찾고 있다고 가정하면 슬라이스가있는 첫 번째 요소가 제거되므로 d.rsplit(' ', 2)[1:]이 표시되어 ['P17544', 'A436T']이됩니다.

압축 풀기를 사용하여 변수 이름을 지정하고 myid, token = d.rsplit(' ', 2)[1:]을 사용하여 길이가 2임을 보장합니다. 정확히 두 요소가 없으면 할당이 실패합니다.

인 자르기를 사용하여 토큰에서 첫 번째 및 마지막 문자를 제거하려는 사용자의 ID는 myid이어야합니다. 그런 다음

: 파일의 라인을 구문 분석 후보고를 들어

: 찾는 약

print myid, token 
# P17544 436 

코멘트

lookup = {} 
for line in file: 
    # do steps above so you have myid, token 
    lookup[myid] = token 

그런 다음 조회를 [ 'P17544'] 것이다 return '436'

희망 사항은 분명합니다 ...

Answer 2

소리가 아주 쉽게 나옵니다. 공백을 따라 나눠서 - 다섯 번째 필드를 추출하고 ... 여섯 번째 필드의 모든 자릿수를 추출하십시오. 또는 나는 무엇인가 놓치고 있냐? 사용

>>> tokens = "COADREAD ATF7 Missense_Mutation NGXA-AZ-3984 P17544 A436T".split() 
>>> print tokens[4] 
P17544 
>>> print ''.join([c for c in tokens[5] if c.isdigit()]) 
436