2017-10-03 2 views
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큰 파일이기 때문에 vcf.gz 파일의 압축을 풀지 않고 내 노트북에는 공간이 없습니다. 나는 일을 시도 :vcf.gz 파일을 vcf.bgz 파일로 직접 변환하는 방법이 있습니까?

gunzip -c file.vcf.gz > bgzip -c > file.vcf.bgz

을하지만 그것은 작동하지 않았다. 생각?

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당신은 그냥 "가 작동하지 않았다"보다 더 많은 정보를 제공해야합니다 오류 메시지가 있었나요? 출력이 있습니까? 즉, @ Pierre의 답변에 동의합니다. 여기서, gunzip의 출력에'>'을 사용하면 파일로 리디렉션됩니다 (실수로'bgzip '라는 파일을 생성하지 않았는지 확인하십시오). 대신에, 이것을'bgzip' 프로그램의 "표준 입력"으로 리다이렉션하고, 파이프 ('|')가이를위한 올바른 도구입니다. – bli

답변

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을 시도
gunzip -c file.vcf.gz | bgzip > file.vcf.bgz 
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