R 여러 파일의 프로그래밍, 읽기 및 실행

Question

일부 유전자 분석에서 COLONY이라는 프로그램을 사용하고 있습니다. 식민지에는 R 패키지 (rcolony)가 있습니다.

내가해야 할 일은 텍스트 파일을 "C :/GenSoftware/Colony/datFiles"디렉토리에서 다른 디렉토리 ("C :/GenSoftware/Colony /")로 이동하는 것입니다. 이름을 "Colony2.dat"로 변경하십시오. 식민지를 실행 한 다음 원본 디렉토리의 모든 파일에 대해 프로세스를 반복하십시오.

이것은 우리가 지금까지 생각 해낼 수 있었던 것입니다. 문제는 모든 텍스트 파일을 순환시키기보다는 동시에 모든 텍스트 파일을 실행하려고하는 것 같습니다.

도움을 주시면 감사하겠습니다. 미리 감사드립니다. 내 컴퓨터에 어떤 집약적 인 물건을 실행 해요 때문에 테스트 할 시간이 없었다

setwd("C:/GenSoftware/Colony/") 
getwd() 
datFiles <- list.files("datFiles") 
library(rcolony) 

for (dat in datFiles) 
{ 
    setwd("C:/GenSoftware/Colony/datFiles") 
    file.rename(dat,"Colony2.DAT") 
    file.copy(from = "C:/GenSoftware/Colony/datFiles/Colony2.DAT",to = "C:/GenSoftware/Colony/") 
    datPath <- "C:/GenSoftware/Colony/Colony2.DAT" 
    setwd("C:/GenSoftware/Colony/") 
    run.colony(colonyexecpath = "Colony2.exe", datPath, wait = FALSE, monitor = TRUE) 
    setwd("C:/GenSoftware/Colony/datFiles/") 
    file.rename("Colony2.DAT",dat) 
} 

Answer 1

setwd("C:/GenSoftware/Colony/datFiles") 
listofFile = list.files() 
Records <- as.data.frame(listofFile) 
count <- nrow(Records) 
x = 1:count 

for(i in seq(along=x)) 
{ 
    file.rename(listofFile[i],"Colony2.DAT") 
    file.copy(from = "C:/GenSoftware/Colony/datFiles/Colony2.DAT",to = "C:/GenSoftware/Colony/") 
    datPath <- "C:/GenSoftware/Colony/Colony2.DAT" 
    setwd("C:/GenSoftware/Colony/") 
    run.colony(colonyexecpath = "Colony2.exe", datPath, wait = FALSE, monitor = TRUE) 
    setwd("C:/GenSoftware/Colony/datFiles/") 
    file.rename("Colony2.DAT",dat) 
} 

죄송합니다.

이 당신이 쓴 무엇

setwd("C:/GenSoftware/Colony/datFiles") 
listofFile = list.files() 
Records <- as.data.frame(listofFile) 
count <- nrow(Records) 
x = 1:count 

for(i in seq(along=x)) 
{ 
    print(listofFile[i]) 
}