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"KO"로 시작하는 줄을 생략하려고합니다. 그러나 코드를 실행할 때 출력 파일에 줄이 여전히 쓰여집니다. 나는 부울 표현식을 호출하여 "KO"가 geneData에 있는지 알아 보았습니다. 그리고 사실로 돌아옵니다. 나는 그 부분 만 붙어있다.특정 문자열로 시작하는 줄을 쓰지 마십시오.
#Read in hsa links
hsa = []
with open ('/users/skylake/desktop/pathway-HSAs.txt', 'r') as file:
for line in file:
line = line.strip()
hsa.append(line)
#Import Modules | Create KEGG Variable
from bioservices.kegg import KEGG
import re
k = KEGG()
##Data Parsing | Writing to File
#for i in range(len(hsa)):
data = k.get(hsa[2])
dict_data = k.parse(data)
#Prep title of file
nameData = re.sub("\[u'", "", str(dict_data['NAME']))
nameData = re.sub(" - Homo sapiens(human)']", "", nameData)
f = open('/Users/Skylake/Desktop/pathway-info/' + nameData + '.txt' , 'w')
#Prep gene data format
geneData = re.sub("', u'", "',\n", str(dict_data['GENE']))
geneData = re.sub("': u'", ": ", geneData)
geneData = re.sub("{u'", "", geneData)
geneData = re.sub("'}", "", geneData)
geneData = re.sub("\[KO", "\nKO", geneData)
f.write("Genes\n")
f.writelines([line for line in geneData if 'KO' not in line])
#Prep compound data format
if 'COMPOUND' in dict_data:
compData = re.sub("\"", "'", str(dict_data['COMPOUND']))
compData = re.sub("', u'", "\n", compData)
compData = re.sub("': u'", ": ", compData)
compData = re.sub("{u'", "", compData)
compData = re.sub("'}", "", compData)
f.write("\nCompounds\n")
f.write(compData)
#Close file
f.close()
문자열에있는 문자열과 같이 작동하지 않는다고 생각합니다. 분리하여 반복해야하지만 확실하지는 않습니다. –