(_io.TextIOWrapper) 데이터를 읽거나 인쇄하는 방법은 무엇입니까?

Question

다음 코드를 사용하여 파일을 열고 내용을 읽고 불필요한 줄을 제거한 다음 파일에 데이터를 쓰고 다운 스트림 분석을 위해 파일을 읽으 려합니다.

with open("chr2_head25.gtf", 'r') as f,\ 
    open('test_output.txt', 'w+') as f2: 
    for lines in f: 
     if not lines.startswith('#'): 
      f2.write(lines) 
    f2.close() 

지금, 나는 F2의 데이터를 읽고 팬더 또는 다른 모듈에 추가 처리를하고 싶어하지만 데이터 (f2를) 읽는 동안 나는 문제로 실행하고 있습니다. (이전 with 블록이 끝날 때) 사용자가 파일에 더 아무것도 할 수

data = f2 # doesn't work 
print(data) #gives 
<_io.TextIOWrapper name='test_output.txt' mode='w+' encoding='UTF-8'> 

data = io.StringIO(f2) # doesn't work 
# Error message 
Traceback (most recent call last): 
    File "/home/everestial007/PycharmProjects/stitcher/pHASE-Stitcher-Markov/markov_final_test/phase_to_vcf.py", line 64, in <module> 
data = io.StringIO(f2) 
TypeError: initial_value must be str or None, not _io.TextIOWrapper 

Answer 1

파일이 이미 닫혀 있습니다. 파일을 다시 열려면 문으로 다른 파일을 만들고 read 특성을 사용하여 파일을 읽습니다.

with open('test_output.txt', 'r') as f2: 
    data = f2.read() 
    print(data)