특정 노드에 대해 OpenMPI 실행 지정

Question

OpenMPI를 사용하여 병렬 컴퓨팅 작업을 실행하고 싶은 이기종 컴퓨팅 클러스터가 있습니다. 클러스터의 모든 노드가 동일한 실행 파일을 실행할 수있는 것은 아니기 때문에 (일부이기 때문에) 노드 중 일부는 자체 버전의 프로그램을 컴파일하고 Open MPI는 해당 노드에서 실행 파일을 호출해야합니다. 나의 첫 번째 질문은 OpenMPI가 이기종 아키텍처 전반에서 이런 종류의 컴퓨팅을 가능하게하는지 여부이다.

그렇다면 두 번째 질문은 어떤 노드에서 실행할 실행 파일을 지정하는 방법입니다. 예를 들어 prog1 및 node3, node4 및 node5prog1 및 prog2이 같은 프로그램하지만 mpicc 또는 mpic++ 래퍼 컴파일러를 사용하여 다른 아키텍처 용으로 컴파일되어 실행 prog2을 실행할 수있는 실행 실행할 수 있습니다 node0, node1 및 node2 말할 수 있습니다. 나는 다음을 수행하는 모든 노드에 병렬로이 프로그램을 실행하고 싶었다면

:

mpirun -n 3 --hosts node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --hosts node3,node4,node5 prog2

그렇지 않은 경우, 나는이 효과를 달성하기 위해 무엇을 할 것인가? This 게시물은 이기종 클러스터 컴퓨팅이 OpenMPI에서 지원되지만 OpenMPI는 --enable-heterogeneous 플래그로 빌드해야 함을 나타냅니다. 내 클러스터가 ArchLinux를 실행하고 있고 pacman으로 OpenMPI를 설치했기 때문에이 작업을 수행하는 방법을 모르겠습니다. 오타가

Answer 1

주 (, 그래서 당신의 명령을

mpirun -n 3 --host node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --host node3,node4,node5 prog2 

--enable-heterogeneous은 MPI는 인텔 x86_64의 사이에 예를 들어, 이기종 시스템 (에서 실행 될 수 있도록 열기 필요한해야한다 (--host는이 s 결말이 필요하지 않습니다) 리틀 엔디안) 및 sparcv9 (빅 엔디 언) 노드). OpenMPI (ArchLinux와 함께 제공)가이 플래그로 구성되지 않은 경우이 패키지를 다시 빌드해야합니다. 다른 옵션은 Open MPI를 재 구축하여 대체 디렉토리에 설치하는 것입니다.

이질적인 지원은 매우 가볍게 테스트되었으며 최신 Open MPI 3.0 시리즈를 사용하는 것이 좋습니다.