R : heatmap.2 컬러 키 변경

Question

gplots에 대한 질문이 있습니다. 나는 기능 heatmap.2을 사용하려면, 따라서 나는 0 1. 일반적으로 symkey=TRUE에 컬러 키에 내 대칭 지점을 변경하려면 당신은 색상과 같이 관리하는 년 Colorbar가 생성되는 col=redgreen() 사용

red = -2 to -0.5 
black=-0.5 to 0.5 
green= 0.5 to 2 

red= -1 to 0.8 
black= 0.8 to 1.2 
green= 1.2 to 3 

이 가능한 같은 것입니다 :

지금 나는이 같은 년 Colorbar을 만들려면?

감사합니다.

Answer 1

the heatmap.2 help file을 보면 breaks 인수가 필요해 보입니다. 도움말 파일에서 :

는

breaks (선택 사항) 색상으로 비닝 (binning)의 X, 또는 브레이크 포인트의 정수에 대한 분할 점을 나타내는 숫자 벡터를 사용 하나,이 경우 브레이크 포인트는 동일한 간격됩니다 min (x)와 max (x) 사이

따라서 breaks을 사용하여 각 색상의 컷오프 지점을 지정합니다. 예컨대 :

library(gplots) 

# make up a bunch of random data from -1, -.9, -.8, ..., 2.9, 3 
# 10x10 
x = matrix(sample(seq(-1,3,by=.1),100,replace=TRUE),ncol=10) 

# plot. We want -1 to 0.8 being red, 0.8 to 1.2 being black, 1.2 to 3 being green. 
heatmap.2(x, col=redgreen, breaks=c(-1,0.8,1.2,3)) 

결정적인 비트가 당신의 단절을되는 breaks=c(-1,0.8,1.2,3)입니다.