Python에서 패키지를 포함하는 R 스크립트 실행 코드

Question

그래서 간단한 R 스크립트를 실행하기 위해 간단한 파이썬 코드로 작업하고 있습니다. R 스크립트는 약 6 행이지만 "pracma"패키지를 사용합니다. 파이썬에서 subprocesses 모듈을 사용하면 스크립트를 실행하지만 일반적인 "Error in library (pracma) : 'pracma'라는 패키지가 없습니다. 나는 비 기본 패키지가 설치된 R 스크립트를 실행할 수있는 간단한 솔루션을 찾고있다. 어떻게 든 rpy2를 사용하여이 작업을 수행 할 수 있지만 pip를 사용하여 설치할 수는 없으며 Anaconda3도 사용하고 있습니다.

전체적으로 나는 패키지가 설치된 R 스크립트를 실행하는 간단한 패키지를 원합니다. 어떤 도움이라도 대단히 감사하겠습니다.

이 내 파이썬 코드의 관련 부분입니다 : @로

Error in library(pracma) : there is no package called 'pracma' 
Execution halted 

Answer 1

감사 :

library(pracma) 

setwd('HausdorffData') 

PointsA <- as.matrix(read.table("HFileA.txt", header = FALSE)) 
PointsB <- as.matrix(read.table("HFileB.txt", header = FALSE)) 

H = hausdorff_dist(PointsA, PointsB) 
write(H, file = "hausdorff.txt",ncolumns = 1, append = FALSE) 

이 다음과 같은 오류가 발생 :

sp.run('Rscript Hausdorff.R', shell=True) 

bFile = open("HausdorffData/hausdorff.txt", "r") 
result = bFile.read() 
bFile.close() 
hausdorff_dist = float(result) 

return hausdorff_dist 

이 내 R 스크립트입니다 이것에 대한 딜레마 :

R이 겉으로보기에는 스크립트를 개별적으로 실행할 수있는 경우에도 R 스크립트를 파이썬과 같은 것으로부터 실행할 때 스크립트가 라이브러리의 경로를 알고 있는지 확인해야합니다. 코드 : 코드 변경 작업 디렉토리를 포함하는 다른 선이

.libPaths(dir\to\package) 

경우 해당 라이브러리 경로를 변경하여 영향을받지 않습니다.