2013-02-22 2 views
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저는 파이썬에서 생물 정보학을위한 CGH 분석을위한 모듈을 찾고 있습니다. 몇 가지 도구를 찾았지만 웹 기반이고 파이썬에서 CGH 분석을 모든 그래프와 함께 처리하는 모듈을 찾지 못했습니다.
커맨드 라인 모듈을 파이썬으로 원합니다.CGH 분석 용 파이썬 모듈

친절히 알려주세요. 누구나 똑같이 알고 있다면.

감사합니다.

답변

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나는 당신을 찾을 것입니다. 배열 작업을하고 명령 행을 통해 그것을 구동하고 싶다면 R을 배우고 CGH 분석을위한 많은 패키지 중 하나를 선택하십시오. 거기에 파이썬/R 바인딩이있어 도움이 될 것으로 확신합니다.

http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html

http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html

http://www.hindawi.com/journals/cfg/2009/201325/

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하지만 파이썬과 같은 언어 CGH의 분야에서 모듈을하지 않아도 가능하다 내가 어떻게이 궁금? – sam

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특수 통계 언어가 아니기 때문에 Perl은 그것들을 가지고 있지 않습니다. 이 문제의 단순한 사실은 R이 이러한 유형의 작업에 훨씬 적합하고 훨씬 더 잘 지원된다는 것입니다. 적절한 작업에 적합한 도구를 사용하십시오 :) – DrDanielSwan