위치를 사용하여 문자열에서 문자를 추출하십시오.

Question

저는 파이썬 초보자이며 파이썬 2.7을 사용하고 있습니다.

나는 DNA 서열 (문자열 dna)을 가지고 있으며 DNA 문자열의 위치에 따라 문자를 추출해야합니다. 위치는 sequence 문자열로 정의됩니다. 여기서 점 앞에있는 첫 번째 숫자는 dna 문자열에서 추출 할 첫 번째 문자를 가리키고 두 번째 숫자는 마지막 문자를 나타냅니다.

저는 이것을 파이썬 프로그램을 가능한 단순하게 유지하면서 루프를 사용해야합니다. 코드를 작성하려고 며칠을 보냈는데 제대로 작동하지 못했습니다. 여기까지 내가 한 일은 있지만 작동하지 않습니다. 어떤 도움이 필요합니까?

dna='abcde'  
sequence=' 0..2, 4..5, 4..5' 
import re  
b=re.finditer('([0-9]{1}\.\.([0-9]{1}))', sequence)  
for j in b:   
    print int(j.group(2))  
a=re.finditer('(([0-9]{1})\.\.[0-9]{1})', sequence)  
for f in a:  
    print int(f.group(2))  
for element in sequence:  
    print dna[int(f.group(2)):int(j.group(2))]  

Answer 1

어떤 약을 .. :

dna='abcde'  
sequence=' 0..2, 4..5, 4..5' 
import re  
b=re.finditer(r'([0-9]+)\.\.([0-9]+)', sequence)  
for j in b:   
    print dna[int(j.group(1)) : int(j.group(2))] 

,210

이 파이썬에서, 마지막 인덱스를 제외, 슬라이스 이후

ab 
e 
e 

를 인쇄합니다. 대신, abc 및 ef보고 싶다면 바로이 print

print dna[int(j.group(1)) : int(j.group(2)) + 1] 

즉에, 바로 슬라이스 구문의 오른쪽 부분에 1을 추가로 변경합니다.

Answer 2

당신은 당신의 패턴 전에 r를 생략 :

>>> b=re.finditer(r'([0-9]{1}\.\.([0-9]{1}))', sequence) 
>>> for j in b: 
... print int(j.group(2)) 
... 
5 
5 

그러나 분할에 대한 당신이 목록의 이해와 str.split() 사용할 수있는 정규식을 필요가없는 순서

:

>>> l=[i.split('..') for i in sequence.split(',')] 
>>> [(int(i),int(j)) for i,j in l] 
[(0, 2), (4, 5), (4, 5)] 

>>> for i,j in indices : 
... print dna[i:j] 
... 
ab 
e 
e 

Answer 3

import re 
dna='abcde'  
sequence='0..2, 4..5, 4..5' 
positionlist = sequence.split(", ") #splits string on, and puts parts in list 
dnalist = list(dna) #splits to seperate letters 
for i in xrange(len(positionlist)): #make an array of arrays (last array has 2 values, start and stop) 
    range1 = positionlist[i].split("..") 
    range1 = map(int,range1) #convert from string to integer 
    print dnalist[range1[0]:range1[1]] 

이것은 정규식이없는 구현입니다. 가장 쉬운 방법은 아닐지 모르지만 나는 너와 마찬가지로 초보자이기도하다.