Biopython의 FASTA 파일에는 어떤 알파벳 유형을 사용해야합니까?

Question

아래 링크에서 FASTA 파일을 사용하고 있다면 Biopython에서 어떤 알파벳 유형을 사용해야합니까? IUPAC.unambiguous_dna일까요? FASTA 파일에

링크 : http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/chromosomes/?C=S;O=A 당신이 3.1 Sequences and Alphabets을

Answer 1

을 읽어나요? 사용 가능한 다른 알파벳과 그 문자가 어떤 경우에 해당하는지 설명합니다.

제공된 링크에는 많은 시퀀스가 ​​있습니다 (너무 많이 뚫어져 있습니다). 내 추천은 UnambiguousDNA과 함께 할 것입니다. 4 개의 기본 뉴클레오타이드가 충분하지 않으면 파서가 불평 할 것이므로보다 광범위한 알파벳을 골라야합니다.