igraph를 사용하여 네트워크를 그릴 때 큰 화살촉 머리

Question

EDIT 내 코드가 무엇이 잘못되었는지 알아 내려고하고 간단한 그래프를 그려 작은 그래프에서 화살표가 어떻게 보이는지 알기 시작했습니다. 나는 다음 명령을 피곤했다.

g2 <- graph(edges=c(1,2, 2,3, 3, 1), n=10) 
plot(g2) 

그리고 내 그래프는 이다. 따라서 문제는 내 코드가 아니라 igraph 또는 R과 함께 있다고 생각합니다. igraph와 R을 다시 설치했지만 문제가 해결되지 않았습니다. 이 문제로 연결되는 패키지 충돌이있을 수 있습니까? 내가 네트워크의 플롯을 생성하기 위해 노력하고

[1] "base"   "boot"   "class"  "cluster"  
[5] "codetools" "colorspace" "compiler"  "datasets"  
[9] "dichromat" "digest"  "doParallel" "foreach"  
[13] "foreign"  "graphics"  "grDevices" "grid"   
[17] "gridBase"  "gtable"  "igraph"  "irlba"  
[21] "iterators" "KernSmooth" "labeling"  "lattice"  
[25] "lazyeval"  "magrittr"  "MASS"   "Matrix"  
[29] "methods"  "mgcv"   "munsell"  "nlme"   
[33] "NMF"   "nnet"   "parallel"  "pkgmaker"  
[37] "plyr"   "RColorBrewer" "Rcpp"   "registry"  
[41] "reshape2"  "rngtools"  "rpart"  "scales"  
[45] "spatial"  "splines"  "stats"  "stats4"  
[49] "stringi"  "stringr"  "survival"  "tcltk"  
[53] "tibble"  "tools"  "utils"  "xtable"  

---

어떤 이유로 나는 내 화살촉 작은 사각형 대신 일반적인 삼각형 화살촉 모양 : 여기에 내가 설치 한이 패키지의 조명된다. 여기

내가 내 플롯을 위해 사용하고있는 코드입니다 :

toy.edges <- na.omit(read.csv("Data/Edge_list-toy.csv", header = TRUE, colClasses = "numeric", na.strings = c("NA", "", "#N/A"))) 
toy.nodes <- na.omit(read.csv("Data/NodesDataF-toy.csv", header = TRUE, na.strings = c("NA", "", "#N/A"))) 
toy.graph <- graph_from_data_frame(toy.edges, directed = TRUE, vertices = toy.nodes) 

V(toy.graph)$color <- "magenta" 
V(toy.graph)$shape <- "sphere" 
V(toy.graph)$size <- 3*15^(ifelse(is.na(V(toy.graph)$node.size), 0.001, 
V(toy.graph)$node.size)) 
plot(toy.graph, layout = layout.fruchterman.reingold(toy.graph), 
    vertex.label=NA, edge.width=E(toy.graph)$weight, 
    edge.arrow.size=0.005, edge.arrow.width=0.0000001) 

그리고 여기 예제 플롯이다 : 나는 edge.arrow.size을위한 약간 더 큰 값을 가질 때

그것은 더 악화 보인다 및 edge.arrow.width.

내 코드가 잘못되었습니다. 그것은 R의 버전과 관련이있을 수 있습니까? 나는 아주 비슷한 명령을 사용하여 1 톤의 플롯을 만들었으며 결코 문제가 없었습니다.

여기에 nodes info 및 edge list 인 파일이 있습니다.

Answer 1

그래서 R이 내 컴퓨터에 그래픽을 표시하는 방법과 문제가있는 것처럼 보입니다. 그림을 콘솔에 직접 그려 보는 대신 파일에 저장하면 모든 것이 잘 보입니다. 나는 그것이 거대한 화살촉 표시로 문제가 해결되지 않고 적어도이 가능한 플롯으로 저장을 생성 할 수 있습니다 실현

png("my-plot.png", width=1200, height=1200) 
par(mar=c(0,0,0,0)) 
plot(mat_gr, layout = layout.auto(mat_gr), vertex.label=NA, 
    edge.width=E(mat_gr)$weight) 
dev.off() 

: 여기 경우 다른 사람에 내가 사용하고 코드 것은 비슷한 문제에 직면 해있다.