R로 실행하기 위해 커맨드 라인 인수로 문자열을 전달할 수 있는지 알고 싶습니다.커맨드 라인 인수가 R
저는 이미 시도해 봤는데 따옴표와 상관없이 공간을 기반으로 구문 분석을한다고 생각합니다.
./R_Script.r abc.bed def.bed "cat bedgraph 1,2"
R로 실행하기 위해 커맨드 라인 인수로 문자열을 전달할 수 있는지 알고 싶습니다.커맨드 라인 인수가 R
저는 이미 시도해 봤는데 따옴표와 상관없이 공간을 기반으로 구문 분석을한다고 생각합니다.
./R_Script.r abc.bed def.bed "cat bedgraph 1,2"
공간을 기준으로해서 구문 분석하면 안됩니다. Rscript
을 사용하고 스크립트 파일을 전달하는 대신 R 스크립트 파일을 직접 실행하려고하는 이유가 확실하지 않습니다. commandArgs()
,이 라인을 실행 : 당신의 R_Script.r
파일은 한 줄이 포함 된 경우 당신이 볼 수 있듯이,리스트의 7 요소가 first second
입니다
[1] "/usr/local/lib/R/bin/exec/R" "--slave"
[3] "--no-restore" "--vanilla"
[5] "--file=R_Script.r" "--args"
[7] "first second"
, 그렇게 :
Rscript --vanilla R_Script.r "first second"
당신을 얻어야한다 공간을 파싱하지 않습니다.
감사합니다, Rscript 스크립트를 직접 실행하는 것보다 훨씬 좋은 방법입니다. –
당신은'commandArgs (trailingOnly = TRUE)'를 사용할 수 있습니다. –
[이 답변] (http://stackoverflow.com/questions/2151212/how-can-i-read-command-line-parameters-from-an-r-script)에서 볼 수 있습니다 –