오류 : ggplot2는 클래스 매트릭스의 데이터를 처리하는 방법을 모릅니다.

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어떻게하면 ggplot을이 데이터와 함께 사용할 수 있습니까? 일반 플로팅을 시도했지만 정상적으로 작동하지만 ggplot을 사용할 때 더 나은 시각화가 필요합니다. 위 오류가 발생합니다. 어떻게 해결합니까?오류 : ggplot2는 클래스 매트릭스의 데이터를 처리하는 방법을 모릅니다.

이것은 스펙트럼 클러스터링 알고리즘의 구현입니다. 코드가 잘 작동하고 데이터가 올바르게 분류됩니다. 이제 이것을 보여줄뿐입니다.

library(ggplot2) 

input_data <- as.matrix(read.table("SpectData.txt")) 
colnames(input_data) <- c("x1", "x2") 

#1- Define Weights matrix 
W <- matrix(0,nrow = nrow(input_data),ncol = nrow(input_data)) 

#2- Define Degree Matrix 
D <- matrix(0,nrow = nrow(input_data),ncol = nrow(input_data)) 

calculateWeight <- function(x1,x2,sigma) { 
    result <- exp(- (norm(x2-x1,type = "2"))^2/ (2*sigma^2)) 
    result 
} 

calcWieghtMatrix <- function(sigma) { 
    for(i in 1: nrow(W)){ 
    for(j in 1: nrow(W)){ 
    if(i == j){ 
     next 
    } 
    if(W[i,j] != 0){ 
     next 
    } 

    W[i,j] <<- calculateWeight(input_data[i,],input_data[j,],sigma) 
    W[j,i] <<- W[i,j] 
    } 
} 
}  

calcDegreeMatrix <- function() { 
    for(i in 1:nrow(input_data)){ 
    D[i,i] <<- sum(W[i,]) 
    } 
} 

executeSpectralClustring <- function (sigma,numberOfClusters){ 
    calcWieghtMatrix(sigma) 
    calcDegreeMatrix() 
    L <<- D - W 
    eigenDecompostion <- eigen(L,symmetric = FALSE) 
    index <- ncol(eigenDecompostion$vectors)-1 
    eigenVector <- eigenDecompostion$vectors[,index] 
    cl <- kmeans(eigenVector,numberOfClusters) 
    ggplot(input_data,col = cl$cluster) 
}  

executeSpectralClustring(0.01,2)

출처

2017-02-06 Muhammed Eltabakh

'매트릭스'를'data.frame'으로 변환합니다. –

입력 데이터를 데이터 프레임으로 변환하면 빈 플롯이 생깁니다! 내가 도대체 뭘 잘못하고있는 겁니까 ? –

정확히 무엇을 생산할 것으로 기대 했습니까? 당신은 실제로 무엇이든 음모를 꾸미는 것을 말하지 않고 있습니다. 'ggplot()'은 데이터 프레임을 받아들입니다 (Sandipan이 말했듯이). 그러면 aestetics를 x, y 값 또는 색상과 같은 플롯 요소에 매핑하는 방법을 말해야합니다. 'col = cl $ cluster'는 ggplot2 스타일이 아닙니다. 당신은'$ '없이 색상을 칼럼 이름에 매핑 할 수있다. 하지만 더 중요한 것은 어떤 기하도 (예 : 점, 막대, 선 등)를 선언하지 않은 것입니다. 그래도 거기에 도움이되는 훌륭한 문서가 많이 있습니다! – Matt74

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는 I는 데이터 프레임으로 input_data 변환 매트릭스가 플로팅 다른 방식으로 해석 될 수있다 아마도 때문에 ggplot 일반 함수 매트릭스 방식이 없기

ggplot(input_data1,aes(x=input_data1$x1, y=input_data1$x2, colour = cl$cluster))+ geom_point(shape=19)

출처

2017-02-06 21:01:12

이 솔루션은 좋은 플롯을 생성 할 수 있지만 ggplot2에서 '$'표기법을 사용하지 않는 것이 더 좋습니다. 그냥 원시 열 이름을 사용하십시오. – Matt74

이제는 지난 10 분 동안 문제가 발생했습니다. 어떤 아이디어 ggplot 내 데이터의 색상을 어떻게 바꿀 수 있습니까! –

그것은 단지 그것을 피하는 습관이 아닙니다. - aes에서'$ '를 사용하는 것은 ** 항상 실수입니다 **. – baptiste

을 사용하여 해결 목적 (예 : 긴 형식으로 변환 할 때 첫 번째 열이 특히 중요하다고 생각해야 하는가?). 당신은 쉽게, (기술적으로 하나가 아마 포티 방법을 작성해야)하지만 자신의 방법을 정의

m <- cbind(1:10, sin(1:10), cos(1:10)) 
ggplot.matrix <- function (data = NULL, mapping = aes(), ..., environment = parent.frame()) 
{ 
    d <- reshape2::melt(as.data.frame(data), 1) 
    ggplot(d, mapping, environment = environment) 
} 

ggplot(m, aes(V1,value, colour=variable)) + geom_line()

출처

2017-02-07 03:18:13 baptiste

그냥 다른 해당 데이터 프레임을 저장할 수 있는지 확인 데이터 프레임에 클래스 행렬을 변환 할 수 있습니다 목적.

dataFrame<-data.frame(classMatrix)

자,이 객체 dataFrame에 사용 ggplot.

출처

2018-02-17 19:37:05 miPlodder

오류 : ggplot2는 클래스 매트릭스의 데이터를 처리하는 방법을 모릅니다.

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