다른 폭발 도구

Question

현재 상업용 또는 비상업적 인 폭발 도구를 찾고 있습니다. 나는 현지 BLAST 검색에 NCBI 폭발을 여러 번 사용했지만 지금은 흥미로운 대안을 찾고 있습니다. 검색 중에 CUDA-Blast, GPU-Blast, WU-Blast, BlastStation2, mpiBlast 및 Turboblast와 같은 흥미로운 결과를 발견했습니다. 누구나 이러한 도구를 경험 했습니까? 또는 BlastStation2와 같은 비슷한 도구가 있습니까? 중요한 상업적 또는 비상업적 인 폭발 도구를 놓친 적이 있습니까?

정말 고맙습니다.

감사합니다,

Beeth

Answer 1

당신은 그것은 오픈 소스 http://www.sequenceserver.com 체크 아웃 할 수 있습니다. 웹 인터페이스를 사용하는 지역 BLAST 서버를 신속하게 설정하는 것이 정말 쉽습니다. (동료와도 공유 할 수 있다는 의미).

면책 조항 : 나는 개발자 중 한 명입니다.

건배,

야닉

Answer 2

는 또한 같은 비교 기능을 제공하고, 더 FASTA 프로그램을 살펴해야한다. FASTA 프로그램은 BLAST 출력을 생성 할 수 있으므로 분석 파이프 라인을 최소한으로 수정해야합니다.

http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta