파일 이름의 일부를 R

Question

에 추출합니다. 폴더에있는 모든 데이터 파일을 열고, 관심있는 데이터를 추출하는 함수 (또는 함수 집합)를 적용하는 코드를 작성하려고합니다. 여태까지는 그런대로 잘됐다. 문제는 파일 이름의 한 요소를 사용하여 각 파일에서 추출한 열 중 하나의 이름을 다시 지정하고이를 추출하는 방법을 파악하는 데 어려움을 겪고 있다는 것입니다.

"YYYY-MM-DD geneName data copy.txt"라는 파일이 있는데 파일 이름의 "geneName"부분을 추출하고 싶습니다. 예를 들어 "2012-05-31 PMA1 data copy.txt"가 있습니다.

날짜 형식은 항상 (YYYY-MM-DD) 동일하며 모든 파일 이름은 "데이터 복사본"으로 끝납니다. txt ".

또한 일부 파일 이름에는 날짜와 geneName 사이의 파일 이름에 추가 실험 주석 ("E (숫자)"또는 "Expt (번호)")이 있습니다 (예 : "2012-05- 21 E7 PMA1 데이터 copy.txt "); 다른 사람은 geneName과 "data copy.txt"사이에 "SDM"을가집니다.

• 2012-05-31 CTN1 데이터 copy.txt (나는 "CTN1을 원하는)
• 2012-05-21 E7 PMA1 데이터 복사 : 여기
  는 일부 파일 이름과 내 원하는 출력의 목록입니다 .txt를

("POX1"를 원하는) ("TDH3"를 원하는)

2012-01-04 POX1 데이터를 copy.txt

2011-11-29 TDH3 SDM 데이터 copy.txt ("PMA1"를 원하는)

내가 어떻게 손으로 일부 파일에서 실험 번호 또는 "SDM"을 삭제하지 않고도 그 작업을 수행 할 수 있습니까?

감사합니다.

Answer 1

여기 패턴은 원하지 않는 E \ digit 또는 Expt \ digit (선택 사항), 원하는 단어, 데이터 복사가 필요없는 선택적 SDM입니다. 여기

> names 
[1] "2012-05-31 CTN1 data copy.txt"   
[2] "2012-05-21 E7 PMA1 data copy.txt"  
[3] "2011-11-29 TDH3 SDM data copy.txt"  
[4] "2012-01-04 POX1 data copy.txt"   
[5] "2011-11-29 ECHO data copy.txt"   
[6] "2011-11-29 E8 ECHO data copy.txt"  
[7] "2011-11-29 ECHO SDM data copy.txt"  
[8] "2011-11-29 Expt2 ECHO SDM data copy.txt" 

내이 sub 것 :

귀하의 E-접두사가 하나 개 이상의 자리가

> sub(pattern="^....-..-.. (E\\d+ |Expt\\d+)*(\\w+) (SDM)*data copy.txt","\\2",names) 
[1] "CTN1" "PMA1" "TDH3" "POX1" "ECHO" "ECHO" "ECHO" "ECHO" 

경우,이 또한 작동 TXT '...

여기 내 테스트 데이터입니다. 나는 E으로 시작하는 테스트 세트에 몇 가지를 추가하여 올바르게 처리되었는지 확인하고, 전자 접두어 인 과 SDM을 사용했다.