파이썬 - 파이썬 호출을 제거

Question

나는 현재 사이 썬 다음 루프를 변환하기 위해 노력하고있어 :

이

cimport numpy as np 
cimport cython 
@cython.boundscheck(False) # turn of bounds-checking for entire function 
def Interpolation(cells, int nmbcellsx): 
    cdef np.ndarray[float, ndim=1] x,y,z 
    cdef int i,j,len 
    for i in range(nmbcellsx): 
     x = cells[i].x 
     y = cells[i].y 
     z = cells[i].z 
     len = x.size 
     for j in range(len): 
     x[j] = x[j] * y[j] * z[j] 

    return 0 

지금까지 모든 종류의 좋아 보이지만, [i]를 세포에 액세스 * 여전히 필요합니다. 파이썬 호출합니다. 이렇게하면 i- 루프의 병렬화가 방지됩니다. 여기

는 사이 썬 피드백 (사이 썬 -a를 생성)되어

cython -a feedback

그러므로 질문 : 이러한 파이썬 콜백 (즉되도록 라인 9-12 화이트가)을 제거 할 수 있는가?

나는이 같은 셀의 유형을 추가 할 때 :

cimport numpy as np 
cimport cython 

cdef class cell_t: 
    cdef np.ndarray x,y,z 

@cython.boundscheck(False) # turn of bounds-checking for entire function 
def Interpolation(np.ndarray[cell_t,ndim=1] cells, int nmbcellsx): 
    cdef np.ndarray[float, ndim=1] x,y,z 
    cdef int i,j,len 
    for i in range(nmbcellsx): 
     x = cells[i].x 
     y = cells[i].y 
     z = cells[i].z 
     len = x.size 
     for j in range(len): 
     x[j] = x[j] * y[j] * z[j] 

    return 0 

을 나는 다음과 같은 사이 썬 오류가 나타날 수 DTYPE은 "개체", 숫자를 입력하거나 구조체 (가 cell_t에 대해 불평해야합니다 선언 내)

고마워요.

Answer 1

당신은 사이 썬 당신의 cells 인수의 유형을 말하고 있지 않으며 따라서는 파이썬는 방법을 찾아 사용합니다. 다음에 정의를 변경해보십시오 :

def Interpolation(np.ndarray cells, int nmbcellsx):

이 그것을 C 액세스를 사용할 수 있습니다 따라서 ndarray 유형을 얻고있다 사이 썬을 알려드립니다.

Answer 2

Typed Memoryview을 사용하면 어떨까요?

import numpy as np 
from cells import cell_t, Interpolation 

x = np.array([1,2,3], np.float32) 
y = np.array([4,5,6], np.float32) 
z = np.array([7,8,9], np.float32) 
c1 = cell_t(x, y, z) 

x = np.array([1,1,1,1,1], np.float32) 
y = np.array([2,2,2,2,2], np.float32) 
z = np.array([3,3,3,3,3], np.float32) 
c2 = cell_t(x, y, z) 

cells = np.array([c1, c2], object) 

Interpolation(cells, 2) 

print c1.x.base 
print c2.x.base 

출력 : 다음`cells` 인수입니다

[ 28. 80. 162.] 
[ 6. 6. 6. 6. 6.]