3 열, 줄 단위로 텍스트 파일의 값에 변수 할당

Question

각 탭으로 구분 된 3 개의 열과 PowerCoords.txt라는 264 개의 행이있는 .txt 파일이 있습니다. 각 행은 x (열 1), y (열 2) 및 z (열 3) 좌표를 포함합니다. 이 파일을 한 줄씩 살펴보고 각 값을 X, Y 및 Z에 할당 한 다음 해당 변수를 다른 함수에 입력하고 싶습니다.

내가 비난에 새로 온 사람, 그리고 내가 행 1의 값을 지정할 방법을 이해하지 않는, 열이 변수 Y하기 위해, 등등 ...

나는 이것을 알고 가능성이 매우 간단하고 Matlab에서 플래시로 할 수 있지만 모든 것을 bash로 유지하려고합니다.

Answer 1

while read x y z; do 
    echo x=$x y=$y z=$z 
done < input.txt 

위의 경우 아무 것도 공백을 포함하지 않아야합니다.

편집 :

의견에 응답

, 여기에 라인 번호 처리 할 수있는 하나 개의 기술이다 :

nl -ba < input.txt | while read line x y z rest; do 
    ~/data/standard/MNI152_T1_2mm -mul 0 \ 
    -add 1 -roi $x 1 $y 1 $z 1 0 1 point -odt float > NewFile$line 
done 

Answer 2

윌리엄 Pursell의 대답은 훨씬 더 똑똑하다,하지만 내 솔직 초보자에서 나는 다음과 같은 노력 마음 전에 약간의 시간 : 당신이 포인트 N 부동 사용하려는 경우

#!/bin/bash 

data="data.dat" 
datalength=`wc $data | awk '{print $1;}'` 

for ((i=1; i<=$datalength; i++)) ;do 

x=`cat $data | awk '{print $1;}' | sed -n "$i"p | sed -e 's/[eE]+*/\\*10\\^/'` ; x=`echo "$x" | bc -l`  ; echo "x$i=$x"; 
y=`cat $data | awk '{print $2;}' | sed -n "$i"p | sed -e 's/[eE]+*/\\*10\\^/'` ; y=`echo "$y" | bc -l`  ; echo "y$i=$y"; 
z=`cat $data | awk '{print $3;}' | sed -n "$i"p | sed -e 's/[eE]+*/\\*10\\^/'` ; z=`echo "$z" | bc -l`  ; echo "z$i=$z"; 

# do something with xyz: 

fslmaths ~/data/standard/MNI152_T1_2mm -mul 0 -add 1 -roi $x 1 $y 1 $z 1 0 1 point -odt float > NewFile$i 

done 

bc과 sed -e 's/[eE]+*/\\*10\\^/' 추가 할 필요가 숫자가 지수 표기법을 사용하는 경우에도 마찬가지입니다.

나는 비슷한 문제가 있었지만 입력 데이터가 많을 경우 배쉬 스크립트는 매우 느립니다. 나는 perl로 옮겼다. 펄에서는 다음과 같이 보일 것입니다 :

#!/usr/bin/perl -w 

use strict; 

open (IN, "data.dat") or die "Error opening"; 

my $i=0; 
for my $line (<IN>){ 
$i++; 
open(OUT, ">NewFile$i.out"); 
chomp $line; 
(my $x,my $y,my $z) = split '\t',$line; 
print "$x $y $z\n"; 

# do something with xyz: 

my $f= fslmaths ~/data/standard/MNI152_T1_2mm -mul 0 -add 1 -roi $x 1 $y 1 $z 1 0 1 point -odt float 

print OUT "f= $f\n"; 
close OUT; 
} 
close IN;