R 출력에서 ​​특정 텍스트 줄을 추출합니다.

Question

R 함수 패키지에서 얻은 결과에서 특정 정보를 추출하려고합니다. 저는 파이썬에 익숙하기 때문에 R 언어를 배우면 혼란 스럽습니다.

내가 필요로하는 모든 단지 마지막 두 숫자 (1, 9), 그에서 읽기,이 (그것을 인쇄 후) appnn의 출력 지금 단백질 응집

Prediction: 
$sequence 
[1] "IFYFYGTTY" 

$overall 
[1] 1.076839 

$aminoacids 
      [,1] 
[1,] 1.076839 
[2,] 1.076839 
[3,] 1.076839 
[4,] 1.076839 
[5,] 1.076839 
[6,] 1.076839 
[7,] 1.028888 
[8,] 1.011057 
[9,] 1.011057 

$hotspots 
$hotspots[[1]] 
[1] 1 9 

을 예측하는 패키지를 가정 이 숫자로 결정된 주어진 문자열의 일부를 추출해야합니다 (이 경우 길이가 1에서 9까지의 길이이므로 전체 문자열입니다).

파이썬에서는 다소 단순하지만 R을 사용하여이를 수행하는 방법을 모릅니다. 많은 감사드립니다.

Answer 1

재현 가능한 예는입니다. 나는 '그래서 여기

Value 

A list containing the amyloidogenicity propensity predictions for the 
polypeptides queried. 

    overall 
    The overall amyloidogenicity propensity prediction value for the sequence 

    aminoacids 
    The amyloidogenicity propensity prediction value per amino acid 

    hotspots 
    A list of the amyloidogenic hotspots predicted in the sequence, limited by the first and last amino acid 

: 문서를 수행 이제 어떻게

library(appnn) 
sequences <- c('STVIIE','KKSSTT','KYSTVI') 
predictions <- appnn(sequences) 

반환 값에 대해 말 : 난 당신이 appnn 패키지를 사용하여이 예에서와 같이라는 개체 predictions를 작성하는 것 같은데요 세 개의 시퀀스를 질의 했으므로 세 개의 요소가있는 R리스트가 반환됩니다. 결과의 요소를 선택하여 각각에 대한 결과를 얻을 수 있습니다. 여기서는 첫 번째로 :

> predictions[[1]] 
$sequence 
[1] "STVIIE" 

$overall 
[1] 0.9497568 

$aminoacids 
      [,1] 
[1,] 0.9497568 
[2,] 0.9497568 
[3,] 0.9497568 
[4,] 0.9497568 
[5,] 0.9497568 
[6,] 0.9497568 

$hotspots 
$hotspots[[1]] 
[1] 1 6 

이것은 명명 된 구성 요소가있는 또 다른 목록입니다. 에 R 벡터 (벡터 및 목록을 반환

> predictions[[1]]$hotspots[[1]] 
[1] 1 6 

을 : 핫스팟 구성 요소는 자체 (결과가 순서에 대해 하나 이상의 핫스팟이 될 수 아마도 때문에) 그래서, 따라서 그것을 얻을 수있는 하나 개의 구성 요소 목록입니다 길이가 2이고 값이 1과 6 인 약간 다른 점이 있습니다.